Tiga Calon Rektor Uncen Berasal dari Fakultas Teknik, Satu Dekan Fisip  

2. Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik (FISIP)

3. Fakultas Hukum (FH)

4. Fakultas Ekonomi dan Bisnis (FEB)

5. Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (FMIPA)

6. Fakultas Teknik (FT)

7. Fakultas Kesehatan Masyarakat (FKM)

8. Fakultas Kedokteran (FK)

9. Fakultas Ilmu Keolahragaan 

Baca juga: Maju Balon Rektor Uncen, Johni Numberi: 6 Prodi Harus Terakreditasi A 

Berikut Jumlah Prodi (program studi) di Universitas Cenderawasih

1. Pendidikan Pancasila dan Kewarganegaraan
2. Pendidikan Kimia
3. Pendidikan Sejarah
4. Bimbingan dan Konseling
5. Ilmu Ekonomi
6. Pendidikan Matematika
7. Teknik Mesin
8. Teknik Elektro
9. Teknik Pertambangan
10. Ilmu Hukum
11. Kesehatan Masyarakat
12. Manajemen
13. Pendidikan Dokter
14. Pendidikan Bahasa dan Sastra Indonesia
15. Pendidikan Jasmani, Kesehatan dan Rekreasi
16. Pendidikan Bahasa Inggris
17. Ekonomi Pembangunan
18. Ilmu Kelautan
19. Farmasi
20. Manajemen
21. Teknik Geofisika
22. Sistem Informasi
23. Pendidikan Guru Sekolah Dasar
24. Pendidikan Olah Raga
25. Pendidikan Bahasa Indonesia
26. Antropologi
27. Kebijakan Publik
28. Ilmu Manajemen
29. Teknik Mesin
30. Teknik Sipil
31. Manajemen Pendidikan
32. Ilmu Administrasi Negara
33. Teknik Mineral
34. Fisika
35. Teknik Elektro
36. Hubungan Internasional
37. Antropologi Sosial
38. Kimia
39. Ilmu Kesejahteraan Sosial
40. Administrasi Perkantoran
41. Biologi
42. Matematika
43. Biologi
44. Pendidikan IPA
45. Akuntansi
46. Ilmu Hukum
47. Akuntansi
48. Ilmu Ekonomi
49. Pendidikan Fisika
50. Ilmu Pemerintahan
51. Pendidikan Biologi
52. Teknik Sipil
53. Keuangan Daerah
54. Pendidikan Geografi
55. Ilmu Sosial
56. Keperawatan
57. Ners
58. Ilmu Administrasi Publik
59. Sosiologi
60. Pengelolaan Sumberdaya Alam dan Lingkungan. (*)